舞蹈欣賞課程內容總結

傣族：孔雀舞藏族：鍋莊諧.卓彝族：煙盒舞，披氈舞壯族：舂堂舞、扁擔舞、蜂鼓舞、采茶舞、戽斗舞、繡球舞、撈蝦舞、斑鳩舞（多模仿動物）朝鮮族：白鶴舞，扇舞農樂舞長鼓舞扁鼓舞蒙古族：筷子舞維吾爾族：盤子舞，手鼓舞苗族:蘆笙舞漢族：山東秧歌，膠州秧歌，云南花燈。

弗拉明戈斗牛舞--西班牙踢踏舞--愛爾蘭芭蕾舞--俄羅斯古代舞、能樂、民俗舞、歌舞伎--日本婆羅多舞--印度

舞蹈分類：古典舞.民間舞.芭蕾舞當代舞國標舞（現(xiàn)代舞）獨舞.雙人舞群舞舞劇

注：軍隊舞蹈屬于當代舞，當代舞大師：吳曉邦，戴愛蓮當代舞《千手觀音》編劇張繼鋼，舞蹈元素：以古典舞為基礎國標舞代表：《別》--倫巴元素《情到深處》分類：摩登舞和拉丁舞

三．《千手觀音》賞析《千手觀音》這部舞蹈作品的創(chuàng)作源于我國敦煌石窟上佛教千手觀音的壁畫形象，該作品創(chuàng)作于201*年，201*年9月28日，在雅典殘奧會閉幕式演出，201*年央視春節(jié)聯(lián)歡晚會演出，取得了一致贊譽。編導為張繼鋼，舞蹈屬于中國當代舞，以中國古典舞為基礎。舞蹈的主題為“慈與愛，美與善”，由21個聾啞演員表演，她（他）們通過舞蹈動作向觀眾展示形象、情感，更結合特制的服裝、舞美、音樂合成一體表達出觀音的至真、至善、至美。這個舞蹈結構上可以分成三段。第一部分：21名舞蹈演員成一直線，利用手的舒展和收縮來展現(xiàn)千手觀音的千姿百態(tài)，手的動作出其不意，領舞面部表情寧靜慈祥，在燈光的映襯下，結合手的各種伸縮，為觀眾表現(xiàn)出了慈祥寧靜的千手觀音的形象。第二部分：音樂發(fā)生了轉換，舞蹈演員離開了圓形的臺面，在更廣闊的舞臺先是前后兩人一排表演出敦煌壁畫上觀音的各種“三道彎”動作，然后四人成一排表演“三道彎”的動作，表現(xiàn)出千手觀音美麗婀娜多姿的形象。第三部分：舞蹈演員又回到一條直線上，在這個過程中，在領舞后面微露頭和手，表現(xiàn)了千手觀音千手千眼的形象。最后以在一條直線上再次以手的舞動作為結尾。關于整個舞蹈給我的感受，首先：這個舞蹈演員很特殊，舞蹈很感人，21的聾啞人能演繹出如此美妙絕倫的舞蹈很不易，這也從一方面確立了這個作品的偉大，與其說她們在表演舞蹈，不如說她們在上演一場弘揚殘疾人自強不息的贊歌。其次：舞臺燈光和音樂設計的很好，特別是第一部分領舞表演三道彎時舞臺燈光的變幻，使得千手觀音的形象莊嚴肅穆。第二部分的音樂個人認為有些激昂，不是太好。最后：這個舞蹈傳達的精神很好，聾啞演員天衣無縫的表演表現(xiàn)了她們自強不息的精神，整個舞蹈給我們展現(xiàn)的千手觀音慈祥安寧的形象呼應了整個舞蹈的主題表現(xiàn)千手觀音：“慈與愛，美與善”，也傳達著世人對構建大愛大善世界的向往。

四．《酥油飄香》賞析

舞蹈的創(chuàng)作背景是表現(xiàn)新時期藏族邊疆人民地區(qū)的軍民和諧共處，軍民魚水相連。創(chuàng)作時間為201*年，編導達娃拉姆。選送單位為西藏軍區(qū)政治部文工團。整個舞蹈以不同于以前的以前的表現(xiàn)形式，虛化軍人形象，重點突出藏族婦女為駐邊軍人打酥油的過程，表現(xiàn)出新時期的軍民魚水情。舞蹈類型為藏族舞和現(xiàn)代舞的結合。屬群舞。

整個舞蹈分三部分：第一部分：點題，舞蹈一開始一名藏族女孩子手提軍用水壺繞場橢圓形一圈。然后一群身穿有袖子的藏族勞動婦女表演了一段后仰的動作，載歌載舞，表現(xiàn)了藏族婦女新的精神面貌。第二部分：打酥油的過程，此段主要是敘事，眾藏族女孩互相比誰打的酥油多和香。此部分的手部用力的打酥油，表現(xiàn)的藏族特別豪放大氣的性格和打酥油的喜歡之情。第三部分：高潮部分，藏族婦女用跨步和搖擺表現(xiàn)她們興奮的心情，運用了手腳步調一致的表現(xiàn)形式，使舞蹈特別靈動。然后以眾女孩把打好的酥油倒進水壺結尾，前后呼應。

關于整個舞蹈給我的感受，首先，我覺得音樂和好聽，在這樣的音樂背景下，透著一股歡快和大氣。藏族年輕女性舞動時身上的掛飾發(fā)出的聲音清脆悅耳，一方面使舞蹈更具有了民族特色，另一方面也折射出了新時代藏區(qū)人民富足的生活。其次:舞蹈的表現(xiàn)形式新穎，整個舞蹈中開始和結尾以一個軍用水壺表現(xiàn)軍人這個形象，魚水之情是通過女孩子們勞作時的情態(tài)和體態(tài)來表現(xiàn)的，年青女子們打酥油的場面輕松、愉快又熱烈，就像是在給自家的兄弟姊妹甚至是心上人打酥油茶，真實可信又倍感平常和隨意，完全將情感定格在友情與親情上。真正體現(xiàn)了軍民魚水情。再次：整個舞蹈開始和結尾的一段舞蹈很有意思，第一部分通過身身體仰靠、雙手搭扣體前、挺胸抬頭，載歌載舞，表現(xiàn)翻身做主，新的時代風貌。第三部分則通過背對觀眾頷首、伏背、塌腰、甩胯，動作隨節(jié)奏變化加力、加速、加大幅度，表現(xiàn)了藏族舞蹈明朗、歡快、奔放的風格特色。藏族人民胸襟坦蕩、樂觀豁達的民族心理通過簡短有力的單一動作展露無疑，極具感染力。同時身體曲線和服飾特色勾勒出藏族年輕女性美麗的背影，既表現(xiàn)了鮮明的個性，又韻味雋永。

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課程內容總結

本學期主要從比較基因組學、功能基因組學、基因組學、結構基因組學四個專題學習了基因組學。

一、比較基因組學

1、比較基因組學的定義：2、同源性和相似性：

3、直向同源物和橫向同源物：4、共線性和同線性：

5、基因組比較的方法：基因組比較是為了確定不同基因組之間的同源序列。①分子雜交比較法：用Southern分子雜交技術確定同源序列�；�因組共線性模式：

A.thaliana和C.rubella的比較遺傳圖譜。②測序比較法：用計算機確定同源序列。③全核苷酸統(tǒng)計比較法

④基因比較法：基因數(shù)目、基因同源性、基因種類、基因結構、基因的功能關系和相互作用。

6、直系同源基因簇：直系同源基因簇數(shù)據(jù)庫能用于預測基因功能。7、鑒別核心功能基因和特殊功能基因

8、基因比較為預測基因關聯(lián)和蛋白質互作提供了可能的方法。8、基因融合的例子

9、基因比較能揭示基因變異

10、基因組對比：基因組對比能揭示同源區(qū)域、微小共線性

11、模式生物體對基因組的研究非常重要：一些總所周知的模式生物體12、總結

二、功能基因組學

1、為什么需要功能基因組學？

①結構基因組學可以揭示基因組中基因的數(shù)量和分布，并預測基因的種類和功能，但這僅僅是預測而已，并不能肯定其確切功能，而且有許多基因的功能還無法預測。

結構基因組學無法知道各個基因參與了哪些生命過程，其表達是如何調控的，不同基因之間是如何互作的。

③總之，結構基因組學無法了解基因的確切功能、表達調控以及相互作用。功能基因組學的產生正是為了研究這些內容。

2、功能基因組學是反向遺傳學：傳統(tǒng)的遺傳學也稱為正向遺傳學，它是在已知基因功能的前提下，去尋找基因（序列）的，亦即“從功能到基因”。功能基因組學正好相反，它是在已知基因（序列）的前提下，去尋找基因功能的，亦即“從基因到功能”，所以也稱為反向遺傳學。

3、功能基因組學研究方法：高通量

①建立大規(guī)模突變體庫及高效篩選：利用T-DNA/轉座子插入建立大規(guī)模隨機插入突變體庫基因機器篩選；利用EMS/輻射誘變建立大規(guī)模堿基轉換或InDel突變體庫基因組誘導局部損傷定點篩檢

T-DNA：T-DNA是農桿菌Ti質粒中的一個片段。農桿菌Ti質�？梢詮闹参飩�口侵入植物細胞，T-DNA可以整合到植物基因組中，并引起細胞瘋狂分裂，形成冠狀腫瘤。

Ti質粒：T-DNA的左右邊界為25bp的重復序列。中間含有一些負責合成植物激素（生

長素、細胞激動素）的基因，正是它們引起腫瘤發(fā)生。vir基因對于T-DNA整合到宿主染色體上是必須的。該基因被植物傷口分泌的小分子物質所激活。

用于基因工程的Ti質粒：一些有害或無用的基因（如合成植物激素的基因）被除去了。增加了一些必須的基因和元件，包括大腸桿菌的復制原點和一些選擇標記基因。目標基因應插入在T-DNA中，因此其中必須有多克隆位點。

T-DNA插入突變有兩種：使基因功能喪失或下降插入基因內部，破壞基因結構或插在基因周圍，抑制基因表達；使基因表達增強在T-DNA中加入增強子，當T-DNA插在基因附件時會增強基因表達。

插入突變體庫的基因機器篩選：采取基因機械篩選的策略，可以同時對許多基因進行篩選，實現(xiàn)高通量的分析目標。主要有以下三種方法：PCR檢測、分子雜交檢測、側鄰DNA測。

誘變突變體庫的TILLING篩選：化學或物理誘變會導致DNA的堿基轉換或插入缺失（InDel）；堿基轉換的結果是突變體與野生型之間存在單堿基多態(tài)性（SNP）；TILLING技術就是在突變體庫中高效的篩檢特定基因特定位點的突變。

EMS誘變庫目標區(qū)域的確定：EMS傾向于產生C/G到T/A的轉換；只有錯義突變或無義突變才可能改變基因功能；根據(jù)基因序列，可以預測EMS產生錯義突變或無義突變的高發(fā)區(qū)，從而作為篩選的目標區(qū)域。

C/G到T/A轉換結果的預測、錯義/無義突變頻率預測、TILLING技術檢測單核苷酸突變的基本原理、Cel1內切酶傾向于在錯配處將DNA雙鏈切斷、用TILLING大規(guī)模檢測EMS突變體庫。

②分析基因表達譜：轉錄組、蛋白組、代謝組

轉錄組分析：轉錄組（transcriptome）是指細胞中所有mRNA的總和。對轉錄組的分析，就是檢測各種mRNA的表達水平，由此可以反映各種基因的表達調控，推斷其可能的功能和作用網絡。

對轉錄組的分析主要有三種方法：SAGE（SerialAnalysisofGeneExpression）、Microarray（微陣列）/DNAchip（DNA芯片）、深度測序

微陣列、陣列技術的應用、DNA微陣列及其特征（高通量、大規(guī)模、全基因組、對比）術語：不同的名稱相同的事物（DNAmicroarray、biochip、DNAchip、genearray、genechip、GeneChip、genomechip）

用于微陣列研究的術語：Probe；Target；Slide,、array、chip

微陣列類型、不同的制作方法、DNA微陣列類型（cDNA、PCR產物、寡核苷酸）DNA微陣列如何工作？微陣列分析的常規(guī)圖表、制作cDNA微陣列的機器、掃描微陣列分析系統(tǒng)、微陣列圖像及圖像分析和相關數(shù)據(jù)分析

利用深度分析基因轉錄組：RNA測序讀數(shù)的多少可以反映基因表達的水平；RNA測序可以發(fā)現(xiàn)潛在的新基因、外顯子和內含子；以發(fā)現(xiàn)非編碼RNA，包括microRNA

4、RNA干擾：RNA干擾是指dsRNA（雙鏈RNA）在細胞中可以誘發(fā)與之同源的mRNA降解，從而導致編碼該mRNA的基因沉默的現(xiàn)象。RNA干擾的最初證據(jù)來自1995年Guo和Kemphues對線蟲的研究。他們發(fā)現(xiàn)，將par-1基因的反義RNA和正義RNA注射進線蟲體內，都能引起該基因的沉默。基于該研究結果，1998年AndyFire首次在線蟲中證明，dsRNA可以有效地、特異地抑制基因的表達。

RNA干擾所需的酶：Dicer：為RNaseIII家族的一個成員，可以產生雙鏈小型干擾RNA（siRNA，長度21~23bp）。該酶含有多個結構域，包括一個解旋酶結構域，兩個相鄰的RNaseIII結構域，以及一個dsRNA結合基元；RISC（RNA-inducedsilencingcomplex）：由RNA誘導的沉默復合體，是一種核酸蛋白復合體；RdRP（RNA-directedRNApolymerase）：

由RNA指導的RNA聚合酶。

RNA干擾的基本過程：Dicer與dsRNA結合，將dsRNA剪切成siRNA；siRNA與RISC結合，形成有活性的RISC復合體；有活性的RISC與目標mRNA結合（siRNA單鏈與mRNA互補），將mRNA切斷。

dsRNA的來源：用于RNA干擾的dsRNA既可以在體外合成，然后導入到受體細胞里，也可以人為地構建一個基因（將目標基因中某一段序列鏡像對接），將它導入到受體細胞，直接在受體細胞中合成dsRNA。該基因具有自互補結構，因而轉錄出來的RNA可以形成發(fā)夾結構。

三、基因組學

1、什么是基因組？基因組是一種生物所擁有的整套遺傳物質，它包含該生物的全部遺傳信息。絕大多數(shù)生物都以脫氧核糖核酸（DNA）為遺傳物質，僅一些病毒以核糖核酸（RNA）為遺傳物質。

2、中心法則：

3、DNA和RNA的一級結構：DNA和RNA是由核苷酸亞基連接成的不分支長鏈大分子。核苷酸亞基由一個核糖、一個磷酸根和一個堿基（嘌啉、嘧啶）組成。核苷酸亞基由一個核糖、一個磷酸根和一個堿基（嘌啉、嘧啶）組成。

4、DNA和RNA的核苷酸：DNA的核苷酸含2′－脫氧核糖及腺嘌啉（A）、胞嘧啶（C）、鳥嘌啉（G）、胸腺嘧啶（T）4種堿基；RNA的核苷酸含核糖及與DNA相似的4種堿基，但其中胸腺嘧啶（T）被換成脲嘧啶（U）。

5、DNA的二級結構：DNA在活細胞中為雙鏈結構，兩個DNA單鏈通過堿基配對（遵循A=T、G≡C的原則），靠氫鍵結合在一起，相互纏繞，形成反向平行的雙螺旋結構。

6、DNA雙螺旋：核糖和磷酸構成雙螺旋骨架，具親水性，處于外側；堿基具疏水性，處于內側；螺旋直徑20；螺距34，含10個核苷酸對；大溝寬而深，扇形>180，小溝窄而淺，扇形<180。

7、DNA的變性：

概念：指在物理或化學因素的作用下，DNA中氫鍵斷裂，雙螺旋解離成兩條獨立的單鏈的過程。

誘因：加熱、變性劑。

DNA變性的特性：增色效應、熔解溫度（Tm）8、DNA的復性：

概念：消除變性因素后，DNA單鏈通過堿基配對重新恢復成雙鏈的過程。若雙鏈為部分變性，則復性可很快完成。若雙鏈為完全變性，則復性需很長的時間，且很難完全恢復到原來結構。

DNA復性的特性：DNA片段越長，序列越復雜，則復性速度越慢；DNA片段越短，序列越簡單，則復性速度越快；復性速度：高度重復>中度重復>低度重復>單拷貝

9、基因組大小（C值）與遺傳信息量

生物進化從低等到高等，從簡單到復雜，遺傳信息量不斷增加，因而基因組（C值）

也應該相應不斷增大。

推論：C值與遺傳信息量應該是平行的，二者是成正比的。

從大的進化尺度看，這個規(guī)律是成立的；從小的進化尺度看，在進化早期（低等生物進化階段）也是成立的，但在高等生物進化階段顯然不成立。

C值悖理（Cvalueparadox）：進化程度低的生物C值反而更高；親緣關系相近的物種間C值差異很大；C值遠遠超過了遺傳信息量的需要；結論：C值并不反映遺傳復雜性的高低。

C值悖理暗示基因組中存在大量的無用序列。

10、原核生物基因組：原核生物基因組通常為一個環(huán)狀DNA分子（染色體）。細菌DNA并非完全裸露，而是與蛋白質結合，這些蛋白質類似于真核生物的組蛋白，對于細菌DNA結構的穩(wěn)定和細胞生長可能起重要作用。原核生物基因組很小，因而其組織結構十分經濟有效，很少含有無用的多余序列。

原核生物基因組的組織結構特征：基因簇（Genecluster）、基因冗余（Generedundancy）、基因重疊（Geneoverlap）

基因簇：指功能相關的一組基因按一定順序成串排列的現(xiàn)象。典型的基因簇即操縱子，轉錄時整個操縱子作為一個單位受調控，轉錄成一條mRNA。例如大腸桿菌的乳糖操縱子由lacZ、lacY和lacA三個與乳糖代謝有關基因串聯(lián)排列而成。

基因冗余：原核生物中，一般蛋白質基因都是單拷貝的，但細菌中rRNA基因（rDNA）是多拷貝的。例如：大腸桿菌，7個拷貝�；�因多拷貝，超過了實際需要，稱為基因冗余，但有備無患。

基因重疊：最初在噬菌體φx174中發(fā)現(xiàn)�，F(xiàn)在已知，基因重疊現(xiàn)象不僅在病毒中有，而且在細菌、細胞器乃至高等真核生物中也有。主要有4種情況：①重疊操縱子：前后兩個操縱子部分重疊；②同相位重疊基因：兩基因閱讀框重疊；③異相位重疊基因：兩基因序列重疊，但閱讀框不同；④反向重疊基因：兩基因序列重疊，但位于不同鏈上。

11、真核生物基因組：除非特別說明，真核生物基因組一般是指其核基因組。真核生物基因組由多個DNA分子組成，每個皆為雙鏈線形分子。每個DNA分子皆與蛋白質結合，構成染色體，染色體上有著絲粒結構，可以進行有絲分裂。

真核生物基因組的組織結構特征：①間斷基因（Interruptedgene）、②基因家族與基因簇（Genefamily&clus）、③串聯(lián)重復基因（Tandemlyrepeatedgenes）、④重復序列（Repeatedsequence）

真核生物基因結構：

12、真核生物染色體的三大要素：著絲粒、端粒、復制原點

四、結構基因組學

一）、基因組研究

1、為什么要研究基因組？2、基因組研究的目的和內容3、基因組研究的分支：

①結構基因組學：研究基因組的組成和結構。

②功能基因組學：研究基因組中所有基因的功能、表達調控和相互關系。③比較基因組學：研究基因和基因組的進化。

4、基因組研究的特點：全局性、高效性、綜合性、先進性二）、結構基因組學

1、結構基因組學的研究內容：遺傳作圖、物理作圖、基因組測序、基因組注釋2、基因組圖：細胞學圖、遺傳圖、物理圖、序列圖，分辨率逐級提高

3、遺傳作圖：應用遺傳學的方法構建能夠顯示基因和特定序列在基因組中的相對位置的圖譜。圖距單位：cM。

遺傳標記：指能夠明確識別的、在生物群體中存在等位差異（稱為遺傳多態(tài)性）的生物學特征。由于遺傳分析是以變異為基礎的，因此，沒有遺傳多態(tài)性的特征是不能做為遺傳標記的。

根據(jù)遺傳多態(tài)性表現(xiàn)的水平，遺傳標記主要有以下幾種類型：形態(tài)標記、生化標記、分子標記。

遺傳作圖的基本原理：連鎖分析

重組率和遺傳圖距：重組率（r）的計算式、作圖函數(shù)、圖距單位

構建分子遺傳圖譜的基本程序：選擇雜交親本；建立遺傳作圖群體；篩選多態(tài)標記；檢測群體中每個個體的標記型；分析標記數(shù)據(jù)，建立連鎖群；確定連鎖群所屬的染色體。

4、物理作圖：應用分子生物學的方法直接分析DNA分子，從而構建能夠顯示基因和特定序列在基因組中的絕對位置的圖譜。圖距單位：kb。

物理圖的構建大致有兩個步驟：建立能夠覆蓋整個基因組的基因組文庫；找出基因組文庫中各個克隆間的相互重疊關系，將它們排列起來，建立克隆重疊群（contig）。

構建基因組文庫的基本程序：提取基因組總DNA；對基因組總DNA進行不完全酶切；針對所用的克隆載體的容量，用脈沖場凝膠電泳（PFGE）技術分離合適大小的DNA片段；將獲得的DNA片段插入到載體中；用攜有插入片段的載體對細菌（或酵母）進行遺傳轉化，將目標DNA片段引入細胞；對轉化細胞進行選擇，建立攜帶不同DNA片段的單細胞系（克�。�。

不完全酶切是為了能夠獲得大小合適、相互重疊的DNA片段。

克隆載體種類：質粒、噬菌體、粘粒、細菌人工染色體、酵母人工染色體。載體的選擇和庫容量的確定：高等生物的基因組很大，因此通常選用克隆容量較大的載體BAC和YAC。YAC雖然克隆容量最大，但它存在轉化率低、分離獲得DNA較難、重組率高的缺點。因此，在BAC能夠滿足需要的情況下，人們更傾向使用BAC而不使用YAC。為了保證所克隆的DNA片段能夠完整地覆蓋整個基因組，并且能夠正確地建立重疊群，克隆片段長度的總和必須數(shù)倍于基因組的長度。例如，國際水稻基因組測序計劃在構建水稻基因組物理圖時，建立的BAC文庫共包含2201*個克隆，每一插入片段平均長度為120kb，總長為26.4億bp，是水稻基因組長度（4.3億bp）的6倍多。

文庫質量的檢驗：在構建好DNA文庫后，還必須對文庫的質量（亦即插入片段的平均長度）進行檢驗。具體做法是：隨機選擇一些克隆，將載體DNA提取出來，用插入位點所對應的限制酶進行酶切，然后在瓊脂糖凝膠上進行電泳，檢測各個克隆插入片段的大小，由此估計整個文庫插入片段的平均大小。

克隆的整理和保存：對獲得的陽性克隆，可以整齊的排放在384孔板上，每個孔放一個克隆，這樣有利于對克隆進行編號和查找。最后將這些克隆放在－84°C超低溫冰箱中保存。

重疊群的構建方法：指紋法、錨標法

5、基因組測序：構建最精細的基因組物理圖譜。圖距單位：bp。①全基因組測序：擬南芥、水稻

②cDNA測序：擬南芥、水稻、其它許多植物種DNA測序方法：鏈終止測序；化學降解測序

鏈終止測序原理：為測定某一種堿基在序列中的位置，在PCR反應體系中同時加入該堿基的脫氧核苷酸（dNTP）和雙脫氧核苷酸（ddNTP）。DNA聚合酶不能區(qū)別dNTP和ddNTP，因而ddNTP也能摻入到合成鏈中。但由于ddNTP中缺少3′位OH基，故鏈合成在其摻入位被迫終止。ddNTP摻入的位置決定了合成的DNA鏈的長度，而DNA鏈的長度可以通過高分辨率的測序膠電泳得以區(qū)分。這樣，按電泳條帶遷移距離的先后順序讀出相條帶遷移距離的先后順序讀出相應的核苷酸（堿基），即可得到被檢DNA的序列。注意應按鏈的合成方向讀序列。

全基因組測序策略：基于物理圖測序、全基因組隨機測序、基于物理圖測序與全基因組隨機測序相結合。

6、基因組注釋：應用生物信息學的方法，對基因組序列進行分析，對其中的各種成分以及可能的基因功能進行標注。

基因組序列的注釋：在得到基因組序列后，接下來的任務就是借助于計算機對序列進行分析，根據(jù)各種基因組成分（包括基因、調控位點、間隔序列、重復序列等）的特征，搞清基因組序列中各個區(qū)段的含義，并將這些信息標注到序列上。這項工作稱為注釋（annotation）。這里最重要的當然是對基因的識別，不僅要識別哪一段序列為基因，而且還要識別它屬于哪一類基因，可能具有什么功能。

7、通過搜索ORF來識別基因：ORF（openreadingframe，開放閱讀框）由起始密碼（ATG）和終止密碼（TAA、TAG或TGA）來確定。理論上可以預計，在隨機的DNA序列中，可能出現(xiàn)的ORF的長度一般都不超過50bp。而基因的ORF的長度一般都在100bp以上。因此，以100bp的ORF長度為界，原則上就能可靠地識別出基因。由于原核生物基因組中沒有內含子，而且很少有間隔序列，因此上述簡單的ORF搜索方法在原核生物中的應用十分有效。但是，該方法在真核生物中卻效果很差，這是因為真核生物中存在內含子和大量的間隔序列。所以，不能用簡單的ORF搜索方法來識別真核生物的基因。

ORF搜索方法的改進：檢查密碼的偏向、檢查外顯子－內含子邊界（剪接位點）、檢查上游控制序列。

通過同源搜索確定基因：所謂同源搜索就是將從ORF搜索得到的可能的編碼序列與保存于基因數(shù)據(jù)庫中的已知基因的序列進行比較。如果被檢序列與某個（些）已知基因序列存在較大的相似性（同源性），則可確定被檢序列是基因序列，并可推斷其功能。隨著基因數(shù)據(jù)庫中登記的已知基因數(shù)量的不斷增加，同源搜索方法變得越來越有效。基因數(shù)據(jù)庫中不僅存有已知功能的基因序列，而且還存有大量的未知功能的基因的表達序列（cDNA）。許多植物都在進行大規(guī)模的cDNA測序工作。因此，以后通過同源搜索確定基因將變得非常容易。用氨基酸序列進行同源搜索更可靠。

序列比較的基本方法：點陣法

8、cDNA測序、cDNA的合成、EST（expressedsequencetag，EST）與全長cDNA、cDNA的克隆、cDNA測序的策略

9、下一代測序技術：高通量測序，深度測序

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